Czernichów est situé sur la rive gauche de la Vistule et son histoire remonte au Xe s. Situé sur une colline, le village de Czernichówek appartenait aux bénédictins de Tyniec, et Czernichów, situé au pied de la montagne de Chełm, à la famille Szydłowiecki. En 1367, le roi Casimir le Grand accorde à Czernichów un privilège selon le droit de Magdebourg. Il appartient à l’époque à la famille Żegota, qui à partir du XVe s. porte le nom de Czernichowski. Après la mort du dernier membre de la famille, le village passe dans le domaine royal. La vie des habitants est axée sur la Vistule. La population s’occupe des activités agricoles. Les bateliers transportent les produits agricoles jusqu’à Gdańsk. On construit des barges transportant des marchandises. Le fleuve change à plusieurs reprises de lit, fertilisant le sol et entraînant la formation d’étangs dans ses méandres. Dans le même temps, il menace constamment d’inondations. Ce désastre survient au XVIIe s., entraînant le transfert du village vers la colline de l’église.
Après le troisième partage de la Pologne, Czernichów passe sous domination autrichienne. A partir de 1815, il appartient à la République de Cracovie. Après la liquidation de l’abbaye bénédictine, la plupart des terres passent dans les mains des paysans. C’est à cette époque que l’artisanat et le commerce commencent à se développer au village. En 1857, la ferme est achetée par la Société d’Économie et d’Agriculture de Cracovie qui y fonde l’École Pratique d’Agriculture. L’école de Czernichów est aujourd’hui la plus ancienne école d’agriculture en Pologne qui fonctionne sans interruption. Czernichów devient, à la fin du XIXe s., le berceau des coopératives rurales en Galicie. Grâce au dr. Franciszek Stefczyk, la première Caisse coopérative d’épargne et de crédit est fondée, donnant lieu au réseau des soi-disant « Caisses de Stefczyk ». Un ferry traverse la Vistule pour relier Czernichów au village voisin de Brzeźnica.
Après le troisième partage de la Pologne, Czernichów passe sous domination autrichienne. A partir de 1815, il appartient à la République de Cracovie. Après la liquidation de l’abbaye bénédictine, la plupart des terres passent dans les mains des paysans. C’est à cette époque que l’artisanat et le commerce commencent à se développer au village. En 1857, la ferme est achetée par la Société d’Économie et d’Agriculture de Cracovie qui y fonde l’École Pratique d’Agriculture. L’école de Czernichów est aujourd’hui la plus ancienne école d’agriculture en Pologne qui fonctionne sans interruption. Czernichów devient, à la fin du XIXe s., le berceau des coopératives rurales en Galicie. Grâce au dr. Franciszek Stefczyk, la première Caisse coopérative d’épargne et de crédit est fondée, donnant lieu au réseau des soi-disant « Caisses de Stefczyk ». Un ferry traverse la Vistule pour relier Czernichów au village voisin de Brzeźnica.
